La Escuela Profesional de Educación fue creada por Resolución N° AU- 05-94-SG- UAC, de fecha 4 de julio de 1994, bajo la gestión de la Comisión Organizadora de la Universidad, presidida por el Ing. Carlos Gómez Palza. Posteriormente, se ratifica por acuerdo de la Asamblea Universitaria, por Resolución Nº AU-05-94-SG- UAC-04-07-95. Se aprueba en la Escuela Profesional de Educación las especialidades de Educación Inicial y Primaria, Matemáticas y Computación, Ciencias Naturales y Ecología y Lengua- Literatura y Extensión Educativa.</p<
El año 1997, se suprime la Facultad de Educación creándose la Facultad de Ciencias Sociales y Educación a la cual se integra la Escuela Profesional de Educación, posteriormente. el año 2015 cambia la denominación de la Facultad como Facultad de Ciencias y Humanidades a la que está adscrita la Escuela Profesional de Educación hasta la fecha.
El año 2017, por resolución 292- CU-2017-UAC, de fecha 4 de julio de 2017, se ratifica el currículo y Plan de estudios de la Escuela Profesional de Educación en la Especialidad de Inicial y Primaria.
La Escuela Profesional de Educación, tiene como propósito fundamental, formar profesionales en el ámbito educativo, cuyo campo laboral es amplio, debido a la demanda de docentes en los diferentes niveles de educación. Las especialidades que ofrece responden a un estudio de mercado, tomando como base una formación humanística, científica, tecnológica, académica y pedagógica, conforme a las exigencias de la población cusqueña y peruana.
El plan curricular está organizado tomando como pilar la visión, misión y valores andinos que contempla la Universidad Andina del Cusco, así como las características educativas del momento, cuyas competencias persiguen el desarrollo armónico de las capacidades, destrezas y habilidades del futuro educador.